La Fundación tiene como máximo órgano de gobierno al Patronato, formado por religiosos Siervos de Jesús y laicos: Rafael Hernando de Larramendi S. de J. (presidente), Juan Álvarez (secretario), Sergio Rodríguez S. de J. (vicepresidente), Ricardo Aldana S. de J. (vocal), y Elena Domínguez (vocal).
La directora es Irene Martín.
La Fundación Maior cuenta además con la ayuda de un Comité Científico y un gran equipo de Responsables de actividades, colaboradores y voluntarios, gracias a la ayuda de los cuales la Fundación desarrolla su actividad. Desde aquí nuestro agradecimiento
Los fundadores, en 2006, fueron: Rafael Hernando de Larramendi S. de J. (presidente), Juan Álvarez (secretario), Mauricio Zarazúa S. de J. (vicepresidente), y Judith Sacristán (vocal).